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人類表達譜晶片 Human OneArray® v5

人類表達譜晶片 v5 延續 “一個基因,一個探針” 的設計原理, 以 IMPORT 專利技術針對蛋白質編碼基因設計高專一性探針, 並以自主的高速佈放技術進行晶片生產。v5 版晶片於 2010 年 7 月正式上市, 根據 RefSeq 38 及 Ensembl 56 資料庫進行探針的更新, 以提供更高基因覆蓋率的表達譜晶片。
 
 
探針資訊


人類表達譜晶片 v5 探針內容
探針種類 探針數
基因探針設計資料庫: 29,187
          - RefSeq release 38
          - Ensembl release 56
控制探針數 1,088
總探針數 30,275



  基因探針
人類表達譜晶片 v5 版次的更新是參考國際公認之 RefSeq 及 Ensembl 序列資料庫, 設計長鏈 60 個鹼基寡核酸 (sense-strand) 的人類表達譜基因探針, 內容以蛋白質編碼基因 (protein-coding gene) 為主,相較於 v4.3 版本, 除了提高整體的基因覆蓋率外,更完整的覆蓋與生理途徑反應相關的基因, 並且每一個探針對其來源資料庫的目標基因皆具高度專一性,避免非目標基因的雜交影響。

此外,華聯專業團隊建構 ”華聯探針註解搜尋引擎” (PASS) 網站,方便使用者查詢各探針相對應於 NCBI 及 Ensembl 資料庫的詳細註解。

<<更多基因探針資訊>>


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  • Gene Lists (下載)
  • GAL Files (下載)
  • GAL Files (200 block ) (下載)
  • Probe Sequences (下載)
  • UCSC Genome Browser Format (下載)
  • 華聯探針註解搜尋引擎 (PASS) <<連結>>
  • PASS 註解 (下載)
 
  控制探針
為確保晶片數據品質,華聯技術團隊經過一連串的測試及驗證,設計一系列的品質控制探針, 以監控完整的晶片實驗步驟,包含樣本 RNA 完整性、樣本 RNA 放大流程、螢光標記效率、晶片雜交、晶片掃描等。
<<更多控制探針資訊>>



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