人類表達譜晶片 (HOA) 晶片控制探針

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晶片控制探針

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晶片控制探針

人類表達譜晶片 Human OneArray^® v5

為確保晶片數據品質，華聯技術團隊經過一連串的測試及驗證，設計一系列的品質控制探針，包含: 定位標記控制探針、掃描強度參考探針、內部品質控制探針、陰性控制探針等，以監控完整的晶片實驗步驟，如樣品 RNA 完整性、樣品 RNA 放大流程、螢光標記效率、晶片雜交與晶片掃描等，以確保產品及數據的品質。

	定位標記控制探針

	定位標記控制探針主要是用來輔助晶片及掃描的定位，依功能不同，又可歸類為三種，包含定向校準標記 (OGAM, Orientation Grid Alignment Mark)、角點校準標記 (CGAM, Corner Grid Alignment Mark) 及矩陣校準標記 (GAM, Grid Alignment Mark)。
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	掃描強度參考探針

	掃描強度參考探針是兩組具有濃度梯度特性的探針，主要的功能是利用探針濃度與訊號螢光強度相對應的關係，用來調整掃描器的條件設定。此兩組探針分別以 Cy3 及 Cy5 進行預標記，不需要經過雜交反應就可以產生 532 nm (Cy3) 或 635 nm (Cy5) 的激發，每一組個包含 8 個濃度梯度，每一濃度的代表探針有 3~6 重複。
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	內部品質控制探針

	為了監測樣品備製備過程中 RNA 放大的效率、樣品 RNA 的完整性及雜交效率等，在每一晶片上設計有三組內部品質控制探針，分別為內部雜交對照探針 (IHC, Intrinsic Hybridization Control) 、內部雜交對照梯度訊號探針 (IHL, Intrinsic Hybridization Ladder)、內部目標品質對照 (ITQC, Intrinsic Target Quality control)。
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	陰性控制探針

	晶片實驗的設計上，常需要利用陰性探針 (Negative Control) 的設計來監測或確認實驗的流程。因此，在 OneArray^® 晶片的針設計上，加入 ArrayControl^™ RNA SPIKE 探針組及外部品質控制探針組（ETQC），此兩組探針與目標基因皆不會產生雜交的反應，可規劃作為監控實驗流程的外源性探針。
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