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  human microarray for gene expression   小鼠表達譜晶片 v2 保留 v1 中專一性佳的 MEEBO 探針, 並依據 RefSeq 42Ensembl 59 資料庫進行探針的更新, 提供更高基因覆蓋率的表達譜晶片。探針設計採用 “一個基因,一個探針” 的設計原理, 以 IMPORT 專利技術針對蛋白質編碼基因設計高專一性探針, 並以自主的高速佈放技術進行晶片生產。
 
 

 
 
    內部品質控制探針  
 
  為了監測樣品備製備過程中 RNA 放大的效率、樣品 RNA 的完整性及雜交效率等, 在每一晶片上設計有三組內部品質控制探針,分別為內部雜交對照探針 (IHC, Intrinsic Hybridization Control) 、 內部雜交對照梯度訊號探針 (IHL, Intrinsic Hybridization Ladder)、 內部目標品質對照 (ITQC, Intrinsic Target Quality control)
 
 
 
中文名稱 代號 探針編號 設計目的 說明
內部雜交對照探針 IHC PH_c_0000100 監測樣品備製與雜交效率 IHC 是包含了11housekeeping gene 的混合探針,可作為陽性控制探針,平均分佈在整個晶片陣列,共有超過 95 個重複。
內部雜交對照梯度訊號探針 IHL PH_c_0000101 ~ PH_c_0000116 監測樣品備製與雜交效率 IHL 是來自於 IHC 的連續稀釋。經過雜交,IHL 的數據可反應出濃度與訊號強度的趨勢線,作為樣品備製與雜交反應的整體效能指標。
內部目標品質對照探針 ITQC PH_mc_0000001 ~ PH_mc_0000014 監測樣品 RNA 長度以評估完整性與放大處理過程 包含 6 個內參照基因,每個基因於自 3’ 端起算的 300~600 bp、900~1200 bp 各設計 1 個探針。
 
  • 內部雜交對照梯度訊號探針 (IHC / IHL)  
 
參照 OneArray® 使用說明設定掃描器後,IHC 訊號值會到達飽和或趨近飽和 (~60,000)。此時,IHL 的訊號值由低濃度到高濃度會呈現線性遞增的現象。  
  • 內部目標品值對照探針 (ITQC)  
 
代號 基因名稱 300-600 nt 900-1200 nt
ITQC_1 TATA box binding protein (Tbp) PH_mC_0000001 PH_mC_0000002
ITQC_2 transferrin receptor (Tfrc) PH_mC_0000003 PH_mC_0000004
ITQC_3 hypoxanthine guanine phosphoribosyl transferase (Hprt) PH_mC_0000005 PH_mC_0000006
ITQC_4 ribophorin II (Rpn2) PH_mC_0000007 PH_mC_0000008
ITQC_6 cathepsin D (Ctsd) PH_mC_0000011 PH_mC_0000012
ITQC_7 vimentin (Vim) PH_mC_0000013 PH_mC_0000014

 
 
   
  在實驗流程及放大效率良好的情況下,所有的 ITQC 探針都可以測得訊號, 而且越靠近 3’ 端的探針會有較高的螢光訊號值, 上圖為 ITQC 探針測試的結果。